Ismét veszélybe került a galaxis, meg kell menteni. A Shepard parancsnok ismét beül ûrhajójába, összetrombitálja a korábbi kalandok után a világegyetem különbözõ pontjaira kavarodott bajtársakat, és kezdetét veszi a csetepaté. A Mass Effect 2-vel megjelent 2008 legjobb sci-fi szerepjátékának méltó folytatása.
A legtöbb jó szerepjátékokhoz hasonlóan a Mass Effect elsõ részében is az egész világ megmentése múlt a játékoson. Ám a számítógépes játékok történetében valószínûleg elõször, ezt a küldetést el is bukhatta. Ha a gamer nem törõdött velük, elhullhattak a társak, ha nem viselte igazán a szívén a sorsát, lerombolhatták a galaktikus tanácsot is.